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Registro Completo |
Biblioteca(s): |
Embrapa Cerrados. |
Data corrente: |
13/06/2001 |
Data da última atualização: |
13/06/2001 |
Autoria: |
CIAMPI, A. Y.; BRONDANI, R. P. V.; GRATTAPAGLIA, D. |
Título: |
Otimizacao de sistemas fluorescentes multiloco e desenvolvimento de marcadores microssatelites para Copaifera langsdorffii Desf. (Copaiba) Leguminosae - Caesalpinoideae. |
Ano de publicação: |
2000 |
Fonte/Imprenta: |
Brasilia: Embrapa Recursos Geneticos e Biotecnologia, 2000. |
Páginas: |
40p. |
Série: |
(Embrapa Recursos Geneticos e Biotecnologia. Boletim de Pesquisa, 16). |
Idioma: |
Português |
Conteúdo: |
Microssatelites constituem marcadores geneticos altamente informativos para estudos de genetica de populacoes pela sua natureza co-dominante, multialelica e pela ampla distribuicao no genoma. Marcadores microssatelites foram desenvolvidos para Copaifera langsdorffii a partir de bibliotecas enriquecidas para sequencias simples repetidas (SSR) AG. Clones positivos foram selecionados por hibridizacao de colonia e sequenciados. Para 34% dos clones sequenciados foi possivel desenhar pares "primers" especificos (de 17 a 20 bases) complementares as sequencias unicas que flanqueiam o microssatelite. Utilizando-se um unico programa de PCR, locos microssatelites foram verificados a partir dos 45 pares de "primers" desenhados. Uma resolucao e identificacao robusta dos alelos a cada loco foram realizadas em gel de poliacrilamida com deteccao a laser de fluorescencias multi coloridas em sequenciador automatico. Oito locos resolvidos em tres sistemas "multiplex" foram caracteizados para conteudo informativo a partir de genotipos obtidos para 96 individuos adultos das populacoes de matas de galeria. Verificou-se uma media de 24,5 alelos por loco, e um elevado conteudo informativo com heterozigosidade media observada (simbolo) de 0,89 e heterozigosidade media esperada (simbolo) de 0,88. Com uma bateria de 8 locos SSR de copaiba, foram estimados a probalidade de identidade (simbolo) que variou de 0,00072 a 0,0402, com valor combinado para 8 locos de 1,11x dez elevado a menos 15 e o poder de exclusao (simbolo) de 0,7093 a 0,88536, com o valor combinado de 99,999993%. Marcadores SSR para copaiba abrem uma ampla perspctiva para a geracao de dados precisos sobre estrutura genetica, fluxo genico e paternidade em populacoes naturais. Estas informacoes serao fundamentais para dar suporte a programas de coleta a conservacao in situ e ex situ desta especie. MenosMicrossatelites constituem marcadores geneticos altamente informativos para estudos de genetica de populacoes pela sua natureza co-dominante, multialelica e pela ampla distribuicao no genoma. Marcadores microssatelites foram desenvolvidos para Copaifera langsdorffii a partir de bibliotecas enriquecidas para sequencias simples repetidas (SSR) AG. Clones positivos foram selecionados por hibridizacao de colonia e sequenciados. Para 34% dos clones sequenciados foi possivel desenhar pares "primers" especificos (de 17 a 20 bases) complementares as sequencias unicas que flanqueiam o microssatelite. Utilizando-se um unico programa de PCR, locos microssatelites foram verificados a partir dos 45 pares de "primers" desenhados. Uma resolucao e identificacao robusta dos alelos a cada loco foram realizadas em gel de poliacrilamida com deteccao a laser de fluorescencias multi coloridas em sequenciador automatico. Oito locos resolvidos em tres sistemas "multiplex" foram caracteizados para conteudo informativo a partir de genotipos obtidos para 96 individuos adultos das populacoes de matas de galeria. Verificou-se uma media de 24,5 alelos por loco, e um elevado conteudo informativo com heterozigosidade media observada (simbolo) de 0,89 e heterozigosidade media esperada (simbolo) de 0,88. Com uma bateria de 8 locos SSR de copaiba, foram estimados a probalidade de identidade (simbolo) que variou de 0,00072 a 0,0402, com valor combinado para 8 locos de 1,11x dez elevado a menos 15 e o poder de ... Mostrar Tudo |
Palavras-Chave: |
Indigenous organisms; Planta nativa. |
Thesagro: |
Cerrado; Copaíba; Copaifera Langsdorffii; Genética Vegetal. |
Thesaurus Nal: |
genetics. |
Categoria do assunto: |
-- |
Marc: |
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